В данной ситуации применима ст. 40 ФЗ № 94 которая регулирует последствия признания аукциона несостоявшимся. Так как ч. 7 ст. 41.1. прямо отсылает вас к ней.
"7. В случае, если открытый аукцион в электронной форме признан несостоявшимся и государственный или муниципальный контракт не заключен с участником размещения заказа, который подал единственную заявку на участие в открытом аукционе в электронной форме или который признан единственным участником открытого аукциона (при наличии таких участников), применяются процедуры, предусмотренные частями 1 и 2 статьи 40 настоящего Федерального закона."
